Новый экспериментальный конвейер системной биологии раскрывает антиметастатический потенциал матайрезинола при раке предстательной железы: интегрированный подход, сочетающий сетевую фармакологию, биоинформатику и экспериментальную валидацию
Фото: Pavel Danilyuk / Pexels
Оригинальное название: Novel systems biology experimental pipeline reveals matairesinol's antimetastatic potential in prostate cancer: an integrated approach of network pharmacology, bioinformatics, and experimental validation
Авторы: Rajadnya R; Sharma N; Mahajan A; Ulhe A; Patil R
Краткое содержание
Матайрезинол (MAT), растительный лигнан, известный своими противораковыми свойствами при гормоночувствительных раках, таких как рак молочной железы и предстательной железы, представляет собой перспективное, но недостаточно изученное направление в лечении метастатического рака предстательной железы (mPC). Чтобы выяснить его конкретные терапевтические мишени и механизмы, в данном исследовании был применён интегративный подход, объединяющий сетевую фармакологию (NP), биоинформатику, функциональный анализ ассоциаций на основе GeneMANIA (GMFA) и экспериментальную валидацию. Путём анализа онлайн-баз данных были идентифицированы 27 общих мишеней mPC и MAT, построена сеть белок-белковых взаимодействий MAT-mPC с помощью STRING, и с использованием CytoHuba выделены 11 ключевых (хаб) мишеней, включая EGFR, AKT1, ERBB2, MET, IGF1, CASP3, HSP90AA1, HIF1A, MMP2, HGF и MMP9. С помощью DAVID анализ Gene Ontology (GO) выявил процессы, связанные с метастазированием, такие как эпителиально-мезенхимальный переход, положительная регуляция клеточной миграции, а также ключевые пути KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes), включая рак, рак предстательной железы, сигнальные пути PI3K-Akt и MAPK, при этом веб-ресурсы, такие как UALCAN и GEPIA2, подтвердили клиническую значимость 11 главных хаб-мишеней в анализе выживаемости пациентов с mPC и в паттернах экспрессии генов. Разработанный авторами инновационный метод обогащения GMFA дополнительно расширил результаты сетевой фармакологии. Анализ молекулярного докинга продемонстрировал существенные взаимодействия между MAT и 11 хаб-мишенями. Исследования моделирования подтвердили стабильность взаимодействий MAT с выбранными мишенями. Экспериментальная валидация на клетках PC3 с использованием количественной ПЦР с обратной транскрипцией в реальном времени и различных клеточных анализов подтвердила антиметастатические эффекты MAT в отношении mPC. Таким образом, этот исчерпывающий анализ сетевой фармакологии в сочетании с GMFA, молекулярным докингом, симуляциями молекулярной динамики и экспериментальными валидациями подчёркивает многогранную роль MAT в воздействии на mPC через различные терапевтические пути. Тем не менее, для закрепления этих результатов необходима всесторонняя валидация in vitro.
Продукция «Вейсфарм»
Витамины, минералы, средства для здоровья и гигиены. Разработка и производство по стандартам ЕАЭС, GMP и ISO. Продукцию можно купить в аптеках и на маркетплейсах.
Обзор научной публикации со ссылкой на первоисточник. Информация носит справочный характер, не является рекламой лекарственных средств или БАД и не заменяет консультацию специалиста.