Геномная характеристика и идентификация генов-кандидатов предполагаемого пути биосинтеза подофиллотоксина у Penicillium herquei HGN12.1C
Фото: Martin Lopez / Pexels
Оригинальное название: Genomic characterization and identification of candidate genes for putative podophyllotoxin biosynthesis pathway in Penicillium herquei HGN12.1C
Авторы: Nguyen DH; Tran QH; Le LT; Nguyen HHT; Tran HT
Краткое содержание
В предыдущих исследованиях сообщалось о функциональной роли, биохимических особенностях и пути синтеза подофиллотоксина (ПТОКС) у растений. В данном исследовании мы использовали комбинированные морфологические и молекулярные методы для идентификации эндофитного гриба и извлечения производных ПТОКС. На основании анализа последовательностей ITS и филогенетического дерева изолят был классифицирован как Penicillium herquei HGN12.1C с идентичностью последовательности 98,58%. Морфологически штамм HGN12.1C характеризуется белыми колониями, коротко разветвлённым мицелием и плотно упакованными гифами. С использованием секвенирования PacBio при средней глубине прочтения 195× был получен высококачественный геном штамма HGN12.1C размером 34,9 Мб, содержащий восемь хромосом, один митохондриальный геном и содержание GC 46,5%. Анализ генома выявил 10 генов, потенциально участвующих в биосинтезе ПТОКС. Эти гены включают VdtD, пинорезинол-лариресинол-редуктазу (PLR), секоизолариресинол-дегидрогеназу (SDH), CYP719A23, CYP71BE54, O-метилтрансферазу 1 (OMT1), O-метилтрансферазу 3 (OMT3), 2-ODD, CYP71CU и CYP82D61. Примечательно, что ген VdtD у грибов функционально схож с геном DIR, обнаруженным у растений. Кроме того, в экстракте HGN12.1C был идентифицирован пелтатин — производное ПТОКС. Докинг-анализ предполагает потенциальную роль фермента 2-ODD в превращении ятеина в дезоксиподофиллотоксин. Эти данные дают ценные сведения о механизме синтеза ПТОКС у грибов, проливая свет на взаимосвязь между растениями-хозяевами и эндофитами.
Продукция «Вейсфарм»
Витамины, минералы, средства для здоровья и гигиены. Разработка и производство по стандартам ЕАЭС, GMP и ISO. Продукцию можно купить в аптеках и на маркетплейсах.
Обзор научной публикации со ссылкой на первоисточник. Информация носит справочный характер, не является рекламой лекарственных средств или БАД и не заменяет консультацию специалиста.