Сплайс-вариант и биоинформатический функциональный анализ гена OsPLR3 у тайского ландраса риса, связанного с биосинтезом лигнанов
Фото: Ron Lach / Pexels
Оригинальное название: Splicing Variant and In Silico Functional Analysis of OsPLR3 in a Thai Landrace Rice Associated with Lignan Biosynthesis
Авторы: Limchareon K; Maneeprasert P; Poonsawat W; Mongkolsiriwatana C
Краткое содержание
Введение: Лигнаны — это полифенолы растительного происхождения с антиоксидантной и фитоэстрогенной активностью. Хотя ферменты пинорезинол-ларицирезинол-редуктазы (PLR) хорошо охарактеризованы у двудольных растений, их роль у однодольных остаётся малоизученной. В данном исследовании охарактеризован ген OsPLR3 — предполагаемый ген PLR у однодольного растения Oryza sativa сорта Mae Phaya Thong Dam. Методы: Ген OsPLR3 был клонирован, и было показано, что он образует три изоформы (OsPLR3-X1, OsPLR3-X2, OsPLR3-X3) посредством альтернативного сплайсинга. Были проведены предсказание доменов, 3D-моделирование (I-TASSER), докинг (CB-Dock2), ОТ-/кОТ-ПЦР, ВЭЖХ, картирование цис-элементов с помощью PlantCARE и филогенетическая реконструкция (MEGA11). Результаты: Изоформы OsPLR3-X1 и OsPLR3-X2 сохранили полные NADPH-связывающие домены с каталитическим лизином (K133), тогда как у X3 отсутствовали существенные мотивы, и её экспрессия не была обнаружена. Только изоформа OsPLR3-X2 была транскрипционно активна в стеблях, листьях, цветках и развивающихся семенах, и её экспрессия возрастала от стадии молочной спелости до стадии зрелого семени, параллельно с накоплением секоизоларицирезинола. Докинг показал сильное связывание OsPLR3-X2 с пинорезинолом (−8,4 ккал/моль) и ларицирезинолом (−9,2 ккал/моль). Филогенетический анализ дополнительно поместил три изоформы OsPLR3 в специфичную для однодольных линию PLR3, отдельную от классической группы PLR1/2 двудольных растений. Заключение: Данные структурного анализа, докинга, экспрессии, профилирования метаболитов и филогении указывают на то, что OsPLR3-X2 является каталитически компетентной изоформой, участвующей в биосинтезе лигнанов в семенах риса. Эти результаты расширяют понимание вторичного метаболизма однодольных растений и подчёркивают, что OsPLR3-X2 является мишенью для метаболической инженерии и повышения нутрицевтической ценности.
Продукция «Вейсфарм»
Витамины, минералы, средства для здоровья и гигиены. Разработка и производство по стандартам ЕАЭС, GMP и ISO. Продукцию можно купить в аптеках и на маркетплейсах.
Обзор научной публикации со ссылкой на первоисточник. Информация носит справочный характер, не является рекламой лекарственных средств или БАД и не заменяет консультацию специалиста.